Abstrakt: | V práci sa zaoberáme problémom vizualizácie zmien poradia génov v genómoch, ku ktorým dochádza počas evolúcie. Práca rozširuje existujúci nástroj na vizualizáciu evolučných histórií EHDraw tak, aby nástroj zobrazoval aj evolučné histórie genómov s viacerými chromozómami. Hlavným výsledkom práce je implementácia optimalizačneho algoritmu na preusporiadanie, otočenie a rezanie chromozómov tak, aby výsledný obrázok bol čo najprehľadnejší, obsahoval minimálny počet krížení a zároveň celá informácia, uložená v evolučnej histórii v ňom zostala zachovaná. Náplňou práce bolo taktiež testovanie algoritmu na evolučných históriách s rôznymi parametrami a hľadanie závislosti medzi danými parametrami a počtom krížení pred a po zbehnutí nášho optimalizačného algoritmu.
|
---|