Meno:Dominika
Priezvisko:Békesová
Názov:Výpočtová analýza genómu kvasinky Magnusiomyces clavatus
Vedúci:doc. Mgr. Bronislava Brejová, PhD.
Rok:2019
Kľúčové slová:skladanie genómu, Magnusiomyces clavatus
Abstrakt:V tejto práci sa zameriavame na skladanie a anotáciu doteraz neposkladaného genómu kvasinky Magnusiomyces clavatus. Používame dáta z troch sekvenovacích platforiem Oxford Nanopore Technologies, Illumina a Pacific Biosciences. S využitím dostupných nástrojov sme docielili poskladanie genómu aj lokálne opravy v sekvencii. Výsledný genóm sme analyzovali existujúcimi nástrojmi na anotáciu. Podarilo sa nám nájsť gény, proteínové domény, a porovnali sme ich príbuznými druhmi kvasiniek. V časti práce sa venujeme aj skladaniu genómu príbuznej kvasinky Magnusiomyces spicifer , ktorej genóm sa nám však nepodarilo kompletne poskladať.

Súbory bakalárskej práce:
Autor nedal súhlas so zverejnením svojej bakalárskej práce.

Súbory prezentácie na obhajobe:

bc(1).pdf

Upraviť