Meno: | Dominika |
---|---|
Priezvisko: | Békesová |
Názov: | Výpočtová analýza genómu kvasinky Magnusiomyces clavatus |
Vedúci: | doc. Mgr. Bronislava Brejová, PhD. |
Rok: | 2019 |
Kľúčové slová: | skladanie genómu, Magnusiomyces clavatus |
Abstrakt: | V tejto práci sa zameriavame na skladanie a anotáciu doteraz neposkladaného genómu kvasinky Magnusiomyces clavatus. Používame dáta z troch sekvenovacích platforiem Oxford Nanopore Technologies, Illumina a Pacific Biosciences. S využitím dostupných nástrojov sme docielili poskladanie genómu aj lokálne opravy v sekvencii. Výsledný genóm sme analyzovali existujúcimi nástrojmi na anotáciu. Podarilo sa nám nájsť gény, proteínové domény, a porovnali sme ich príbuznými druhmi kvasiniek. V časti práce sa venujeme aj skladaniu genómu príbuznej kvasinky Magnusiomyces spicifer , ktorej genóm sa nám však nepodarilo kompletne poskladať. |
Súbory bakalárskej práce:
Autor nedal súhlas so zverejnením svojej bakalárskej práce.
Súbory prezentácie na obhajobe:
bc(1).pdf |