| Meno: | Ján
|
|---|
| Priezvisko: | Hozza
|
|---|
| Názov: | Rekonštrukcia histórií génových zhlukov
|
|---|
| Vedúci: | Mgr. Tomáš Vinař, PhD
|
|---|
| Rok: | 2016
|
|---|
| Blok: | INF
|
|---|
| Kľúčové slová: | DNA sekvencia, génový zhluk, rekonštrukcia, strojové učenie, evolúcia
|
|---|
| Abstrakt: | Keď nastane viacero dlhých duplikácii v jednej časti DNA sekvencie,
môže to mať za následok vznik génového zhluku so zložitou štruktúrou.
Aby sme mohli lepšie porozumieť funkcii génov v zhluku,
snažíme sa odhaliť, aké dlhé mutácie v sekvencii nastali.
Tento problém sa nazýva rekonštrukcia histórie sekvencie.
V tejto práci vylepšíme predošlý
algoritmus na rekonštrukciu histórií využitím
informácií získaných z evolučných stromov pre úseky sekvencie.
Pomocou metód strojového učenia naučíme algoritmus robiť komplexné
rozhodnutia a rozlišovať medzi správnymi a nesprávnymi duplikáciami.
Podrobne preskúmame úspešnosť nových metód a porovnáme rôzne varianty
algoritmu.
|
|---|