Meno:Jana
Priezvisko:Černíková
Názov:Algorithms for dynamic assembly of nanopore reads
Vedúci:doc. Mgr. Tomáš Vinař, PhD.
Rok:2024
Kľúčové slová:zostavovanie genómov počas sekvenačného behu, nanopórové sekvenovanie, monitorovanie sekvenovania
Abstrakt:Jednou z výhod nanopórového sekvenovania je, že sekvenované čítania sú dostupné v reálnom čase a je možné upravovať parametre sekvenovania počas behu na základe ich priebežnej analýzy. Preskúmali sme možnosti vytvorenia algoritmov ktoré by mohli byť použité na dynamické zostavovanie sekvencií zo sekvenovaných čítaní v reálnom čase a implementovali sme nástroj, ktorý uchováva reprezentatívnu vzorku z čítaní, dynamicky zostavuje čítania počas sekvenačného behu a zobrazuje výsledky z dostupných dát používateľovi v reálnom čase.

Súbory diplomovej práce:

main-en.pdf

Súbory prezentácie na obhajobe:

Obhajoby.pdf

Upraviť