| Meno: | Adam
|
|---|
| Priezvisko: | Mikušovský
|
|---|
| Názov: | Efektívne vyhľadávanie záznamov v databáze dbNSFP
|
|---|
| Vedúci: | Mgr. Jaroslav Budiš
|
|---|
| Rok: | 2015
|
|---|
| Kľúčové slová: | Genetický variant, Databáza dbNSFP, Efektívne dátové štruktúry
|
|---|
| Abstrakt: | Databáza dbNSFP zhromažďuje údaje o genetických variantoch v textových
súboroch typu TSV. Veľký objem dát komplikuje vyhľadanie potrebných
záznamov. Navyše údaje majú špecifické usporiadanie vo forme intervalov,
vďaka čomu je možné použiť efektívnejší spôsob získania požadovaných údajov.
Cieľom bakalárskej práce bolo implementovať a porovnať viacero dátových
štruktúr na získavanie dát s tejto databázy, ako aj porovnanie z existujúcou
SQL a NoSQL databázou. Výsledkom práce je nosný zdroj atribútov genetických
variantov pre webovú službu Variant Annotation Service.
|
|---|